于是，尼尔（人类）和妹妹就被骗来，

和所有人一起被扔到了新宿的围墙中。

果然，抽出灵魂的人，一个个崩坏。

尼尔不能力敌，无奈之下，

还是打开了书。

结果，

巧的来了，

尼尔，就是这个难得的、安定的灵魂。

但悠娜（人类）的病情恶化，不得已打开书被抽取灵魂。

不同于尼尔，悠娜的灵魂刚被抽出，就开始崩坏。

于是，

哈梅尔机关与尼尔做出交易：“你为我们全人类的灵魂提供稳定的魔素，我们免费给你妹妹的灵魂冷冻起来，暂时不会崩坏。1000多年后，你妹妹不就有救了吗。”

尼尔一听，

可以！

不过，

人工生命体，真的没有意识吗？

答案是否定的，

700多年后，人工生命体开始学会了思考。

于是，

在人工生命体的聚落，有两种型号的机械人造人——迪瓦菈、波波菈，

职责用来负责人工生命体的产生、管理，以及监视其是否诞生意识，是否予以抹杀。

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于是，1000多年后，

3465年，

尼尔：人工生命，故事开始。

真正的人类早已灭绝。

主角，正是尼尔（人工生命体）。

而悠娜（人工生命体）也患上了和人类悠娜一样的白盐病。

不出意外，格式塔计划就要出意外了。

迪瓦菈、波波菈不忍心对产生意识的尼尔下手。

被尼尔找到的白之书失忆了，

面对黑之书的提醒，白之书表示不干，

老子就是